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三叉神经痛的病因有很多,常见的如高血压病、多发性硬化、肿瘤压迫三叉神经、脑部病灶、手术造成的损伤、中风、面部创伤等。
三叉神经痛的发病机制具体尚未明确,目前公认的是微血管压迫学说:是指颅内微小动脉长期压迫三叉神经出脑干处,使三叉神经根的感觉轴突发生脱髓鞘的改变,导致神经异常放电,引起电击样疼痛,学者们在三叉神经痛患者中也发现了高比例的血管压迫现象。搏动的血管持续冲压三叉神经,会导致疼痛的长期反复发作。
除此以外,还有过敏反应学说、骨性压迫学说及点燃学说等等。